Établie en tant que réserve marine fédérale en 1984, la zone protégée de 1 383 hectares s'étend des arches rocheuses visibles jusqu'aux récifs submergés à une profondeur de 480 mètres. La topographie sous-marine du parc crée des remontées d'eau riches en nutriments qui soutiennent 67 espèces de coraux répertoriées et plus de 250 espèces de poissons tropicaux, ce qui en fait le site de plongée avec tuba le plus riche en biodiversité le long de la côte de Jalisco.
Le drame géologique au-dessus de l'eau reflète la complexité en dessous. Des colonnes de basalte volcanique encadrent des tunnels et des grottes naturels où la houle du Pacifique se comprime et se relâche, générant les sons hydrauliques qui ont donné leur nom aux arches. Pendant les mois d'hiver, les baleines à bosse passent à moins de 200 mètres des formations lors de leur migration annuelle de l'Alaska vers les lagunes de reproduction plus au sud. La position du parc, au confluent des courants tropicaux chauds et des remontées d'eau plus froides de la fosse profonde de Banderas, crée des couches thermiques où les espèces pélagiques, notamment les raies mantas, les raies aigles tachetées et les bancs saisonniers de thons à nageoires jaunes, croisent les populations récifales résidentes.
Les protocoles de conservation promulgués en 2019 restreignent l'accès des navires motorisés aux couloirs désignés, préservant ainsi les zones de régénération corallienne endommagées par le traînage des ancres au cours des décennies précédentes. Les frais d'entrée de 43 pesos financent les stations de surveillance des récifs exploitées par des biologistes marins de l'Université de Guadalajara, qui effectuent des enquêtes trimestrielles sur la biodiversité et suivent les taux de récupération dans les sections précédemment dégradées. La visibilité dans l'eau fluctue entre 12 et 30 mètres selon les cycles de floraison du plancton, les conditions les plus claires se produisant entre novembre et mai lorsque les vents du nord s'apaisent et que la suspension des sédiments diminue.
L'accès à la plongée avec tuba est possible toute l'année, bien que les conditions optimales correspondent à des mers plus calmes pendant les heures du matin avant que les vents thermiques de l'après-midi ne s'intensifient. La proximité du parc marin avec la zone hôtelière sud de Puerto Vallarta — environ 12 kilomètres par bateau — en fait la destination sous-marine principale pour les visiteurs cherchant des écosystèmes récifaux sans traversées en pleine mer. Les voyagistes au départ de la jetée Los Muertos et de Boca de Tomatlán allouent généralement 90 minutes pour l'exploration sous-marine sur trois sites de récifs distincts, chacun offrant des caractéristiques géologiques et des concentrations d'espèces uniques.
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